Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms