Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB35Q15286 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB35Q15286 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB35Q15286 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB35Q15286 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB35Q15286 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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