Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRKQ15262 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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