Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC3Q15034 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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