Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NWD1Q149M9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NWD1Q149M9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms