Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE7AQ13946 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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