Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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