Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CUL4AQ13619 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CUL4AQ13619 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CUL4AQ13619 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CUL4AQ13619 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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