Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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