Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCOF1Q13428 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCOF1Q13428 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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