Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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