Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms