Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms