Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALD1Q05682 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms