Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms