Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RELAQ04206 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RELAQ04206 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RELAQ04206 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RELAQ04206 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RELAQ04206 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RELAQ04206 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELAQ04206 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms