Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms