Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms