Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms