Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms