Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX1P83916 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX1P83916 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX1P83916 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX1P83916 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 710.9 ms