Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG7P83436 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG7P83436 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms