Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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