Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSX2P58304 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms