Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMP3P54852 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms