Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA3P52797 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms