Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms