Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCAMP43121 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCAMP43121 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms