Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms