Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms