Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NUP214P35658 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP214P35658 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP214P35658 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms