Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD40LGP29965 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CD40LGP29965 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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