Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms