Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PLNP26678 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PLNP26678 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PLNP26678 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms