Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LMNB1P20700 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms