Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms