Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DOBP13765 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms