Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms