Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms