Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI4P10075 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI4P10075 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms