Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms