Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYC1P08574 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms