Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3P05106 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms