Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TYMSP04818 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms