Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTA1P02549 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTA1P02549 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms