Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PROM1O43490 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PROM1O43490 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PROM1O43490 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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