Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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