Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms