Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3CA6NKF2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms