Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms